cuando creas un archivo nuevo te ocupa espacio en la unidad, cuando lo modificas te escribe en otro sector la modificacion pero teniendo un puntero en la memoria, que siempre apunta a esa direccion en memoria, entonces cuando copias un archivo, lo pegas en otro lado o lo eliminas, ese espacio aun esta ocupado aunque el "fisico" no exista, por eso, la desfragmentacion hace que se libere todo el espacio que este ocupado por basura o por espacio haciendo espacio.
al liberar el espacio los archivos se vuelven mas contiguos por lo tanto es mas facil la recuperacion del mismo, o el mapeo de la unidad.
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